基础生物学事项

作物图像2每一篇科学论文是从最初的假设作出最后结论的旅程的故事。这可能需要几个月或几年,并包括在一个时间精心一个采取了许多措施。实验重复,对照验证,阴性和阳性结果进行分析,直到最后的故事是有意义的。有时候,故事的结尾证实的假说,有​​时它是一个惊喜。在上周发表的一篇论文细胞描述了一个研究,其中一组研究人员的调查基础生物学(信号复合物工程的一个组成部分如何),发现在不同的领域意想不到的和潜在的应用显著(癌症研究)一个问题。

该论文发表在6月6日的《中国日报》上细胞,描述了在低氧条件下与细胞存活相关的基因调控中,转录因子HIF1A和细胞周期蛋白依赖性激酶cdk8之间未知的相互作用。随附的一份新闻稿描述了CDK8在这一过程中作用的发现如何可能对癌症研究产生影响,因为CDK8可能是对抗“缺氧”肿瘤药物的潜在靶点。

当肿瘤的血液供应不足,肿瘤内的细胞处于低氧环境时,就会发生缺氧。缺氧肿瘤与阴性结果相关,表现出对治疗的抵抗和更大的转移可能性。肿瘤内的细胞通过表达大量的基因来对低氧环境做出反应,使其能够在这些条件下生存。转录因子HIF1A是一种已知的致癌基因,在细胞对缺氧的反应中起关键作用;然而,迄今为止,开发针对HIF1A的抗癌药物的尝试并未成功,HIF1A与RNA聚合酶II相互作用以激活缺氧调控基因转录的具体机制尚不清楚。

在新闻稿中,从大学的通讯作者,华金·埃斯皮诺萨科罗拉多描述HIF1A和CDK8和癌症研究的“serendipidious”随后的连接关系的发现。研究人员并没有着手研究对缺氧的细胞反应,而是研究基因调控,特别是正在鉴定调节蛋白复合物称为调解激酶CDK8作用的生物学基础。介体是一个多部分大信号分子与许多细胞成分包括染色质,转录因子和RNA相互作用聚合酶II。几个中介的组件,包括CDK8,都经过基因复制产生对称为旁系同源物的分子。CDK8及其旁系同源CDK19是调解复杂的可选组件。研究人员试图确定在这方面CDK8的功能。

最初,作者使用卤素标签融合CDK8或CDK19构建转染了同时表达CDK8和CDK19的结直肠癌细胞系,并在拉压试验中使用这些基因识别与CDK8或CDK19相互作用的蛋白。这些实验表明,中介复合物要么含有CDK8,要么含有CDK19,但不是两者都含有。然后他们使用微阵列分析CDK8或CDK19的表达被抑制的细胞,以确定这些分子是如何影响基因表达谱的。他们还将敲除细胞置于各种应激刺激下,其中一种是缺氧,并评估应激条件下的表达谱。在这一点上,CDK8和细胞对缺氧反应之间的初始联系变得明显。

接下来,研究人员研究了CDK8是否为HIF1A的共激活因子,使用qRT-PCR分析了CDK8敲低或HIF1A敲低对他们发现受CDK8调控的缺氧相关基因的影响。结果表明,大多数cdk8调控基因的诱导都需要Hif1A。然后,他们使用各种芯片分析来阐明缺氧条件、CDK8与缺氧(和HIF1A)调控基因上游调控序列的结合、HIF1A招募和RNA聚合酶II激活之间的许多复杂关系。最终,他们能够确定HIF1A通过CDK8作用,使细胞能够对缺氧环境作出反应,并在此过程中确定了之前未知的CDK8、HIF1A和RNA聚合酶II之间的相互作用,这些相互作用导致转录的起始。

其结果是令人兴奋的,因为与激酶抑制剂,现有类药物为目标CDK8潜在的癌症研究。

这是新闻稿

而这里的纸:
ResearchBlogging.org加尔布雷思,M.,艾伦,M.,Bensard,C.,王,X.,施温,M.,秦,B.,龙,H.,丹尼尔斯,D.,哈恩,W.,韦尔,R.,&埃斯皮诺萨,J。(2013)。HIF1A拥有员工CDK8,中保激发RNAPII伸长其缺氧细胞,153(6),1327年至1339年DOI:10.1016 / j.cell.2013.04.048

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伊泽贝尔存在

伊莎贝尔毕业于爱丁堡大学和英国伯明翰的阿斯顿大学。她是一名技术作家和编辑,也是Promega科学传播小组的经理。她喜欢写科学和传播方面的文章。

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