使用全基因组测序识别驯养动物的祖先

全球可以在全球范围内发现哪些动物三到一个人?Gallus Gallus Domesticus.,卑微的鸡肉。对鸡蛋和瘦肉的胃口胃口的需求对这种羽毛鸟的需求,导致家禽人口超过20亿。

对国内鸡的起源(何处和哪些物种)引导了一些研究人员来寻找当代鸡品种和野生丛林家禽的基因组中的信息,鸡派的群体中的一些研究人员来看。通过从亚洲国内家禽的600多种基因组和来自所有四个野生丛林禽类的160种基因组测序,王某。想要了解并识别这些物种之间的关系和相关性,并得出驯化鸡第一次出现的地方。

在亚洲发现的红丛林母鸡长期以来一直是驯养鸡的可能候选人。然而,研究人员首先使用了他们在野生丛林鸟类上获得的数据来了解这些鸟类之间的关系。他们发现所有丛林禽类和红丛林鸡亚种都是遗传不同的。每个野生鸟类都位于地理上亚洲地区(例如,G. g。慕吉在印度北部找到G. g。底岸是东爪哇省)。研究人员得出结论G. g。底岸展示了最多的多样性,使其成为系统发育树中的其他红色丛林母猪的祖先。

谁是国内鸡的祖先?

系统发育分析还用于确定哪些红色丛林禽群可能是国内鸡的起源。基于149个红丛林家禽基因组和696家国内鸡基因组,包括在本研究之前可用的序列,除了两只国内鸡之外的所有鸡都是一块野生G. g。Spadiceus.个人,建议这些鸟类分享了一个共同的祖先。额外的分析表明,国内鸡基因组聚集在一起G. g。Spadiceus.,目前在中国西南部,泰国和缅甸发现,而不是其他四个红色丛林鸟类。使用算法估计何时G. g。Spadiceus.国内鸡彼此分开,王。计算拆分大约9500年前,违背了其他考古研究,建议鸡在中国北部的新石器时和印第安纳州的新石器时士驯化。

Gallus Gallus Spadiceus.,一个红色的丛林鸟亚种。图片版权所有:Garry Bakker托管在PBase上。

虽然这个基因组研究表明了一个特定的红丛林鸟类是国内鸡的可能祖先,但国内鸡和红丛林家禽中仍然存在一些基因流。虽然一些这种遗传交流是由于地理,王。发现商业蛋敷料的白雷干,无论基因组样品来自伊朗,中国,意大利还是美国,占祖先的25%G. g。慕吉,印度北部的一个红鸡亚种。这种杂交事件可能发生在基于白leghorns之间的单倍型块的长度的鸡驯化后发生G. g。慕吉与白leghorns之间的较短较短的人相比G. g。Spadiceus.

国内鸡的基因选择

通过所有这些基因组数据,研究人员可以使用野红丛林家禽亲属在驯化鸡中选择哪些基因的任何结论?与丛林家禽相比,国内鸡成熟速度更快,生产更多的鸡蛋。毫不奇怪,参与调节性成熟和繁殖,新陈代谢,肌肉和骨骼发育的基因表明变化。并且是一种无意义的突变,是疑似驯化的轨迹是固定在国内鸡中,并且在红色的丛林家禽中缺席。王。注意到这种突变被发现在高频中G. g。Spadiceus.,祖先对本研究确定的国内鸡,但在低频频率的其他红色丛林鸟类。

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研究人员通过收集来自数百只鸡和野生丛林家禽的DNA样本,研究人员在这些鸟类中审查了相关性,为国内鸡创造了一棵家谱,并确定了野生丛林鸟类的祖先的祖先。与以前的研究不同,这项研究确定了一个特定的红丛林鸟类亚种,作为可能的祖先,并根据当前地理位置置于驯化事件G. g。Spadiceus。这些结论的一个警告是所检查的基因组是来自现代物种,鸡和丛林家畜。王。相信测序的基因组的数量可以区分丛林禽类和鸡之间的杂交和鉴定国内鸡祖先,测序古鸡仍然会帮助忍住这方面的断言细胞研究文章。

参考:
王,M.等等。(2020)863基因组揭示了鸡的起源和驯化。res.30,693-701。https://doi.org/10.1038/S41422-020-0349-Y.

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Sara Klink.

技术文件撰稿人Promega Corporation
萨拉是一家位于第五代奶牛场的威斯康星州,并决定成为12岁的科学家。她在威斯康星大学 - 公园旁门教育,在那里她获得了B.S.在威斯康星大学 - 麦迪逊颁发的第二阶段肿瘤学位之前,在生物学和分子生物学硕士学位。她为Promega Corporation工作了15年以上,首先是一位技术服务科学家,目前是技术作家。萨拉喜欢谈论她的娱乐鸡群,试图在规划春天的花园时不要太雄心勃勃。

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