自动化法医DNA纯化以满足迫切需要:2001年9月11日的反思

2001年9月,Allan Tereba(中心,blue polo)与纽约市首席法医办公室(OCME)的技术人员一起讨论自动化法医DNA纯化。
Allan Tereba(蓝色马球中心)于2001年9月在纽约市首席法医办公室(OCME)与技术人员一起工作。

2000年夏天,Promega研究科学家Allan Tereba被要求为法医开发一种自动净化DNA的协议。他的团队最近推出了DNA IQ,这是第一个使用磁珠纯化法医DNA的Promega试剂盒。那是在Maxwell®仪器和Promega纯化化学广泛适用于高通量自动化之前。

“我对能够这样做的疑虑,”艾伦说。“当你使用strs时,少量的污染物DNA会弄乱你的结果。但我前进并尝试过,这是一个挑战。“

一年多以后,艾伦在办公室里听到广播说一架飞机撞向了纽约世贸中心的北塔。不久之后,他听到广播说第二架飞机撞上了南塔。

到那个点,艾伦和他的同事成功地调整了DNA IQ,以便在机器人的甲板上使用。在攻击时期,Promega科学家支持纽约市政办公室的首席医学审查员(OCME),纽约州警察在他们的工作中识别从地面零恢复的人类遗体。

由于艾伦和许多其他Promega科学家的工作,帕多巴准备提供迫切需要的独特解决方案。用自己的话说,这里有一些科学家的思考。

自动化法医DNA纯化

Allan Tereba,高级研究科学家*:2000年底,我的老板来找我说:“我想让你把DNA智商加到一个机器人系统上。”我说:“好吧,这很难。我想在那个时候,有一些机器人系统可以净化DNA,但它们只是作为参考样本。我们必须设计一个磁铁,正好适合96孔板。我得花时间学习如何给机器人编程,不过最难的是如果你想从珠子上提取DNA,你必须加热它,然后使劲摇晃它。我很害怕,因为风险很大,但实际上效果很好。我用深井盘和相当少量的液体。我做了一些实验,做了一些聚合酶链反应测试,看看是否有交叉污染,我在对照中没有看到任何东西。就在那时我说"天啊,这能行"

2001年初,在炼制议定书后,艾伦和其他几个帕尔姆斯科学家与弗吉尼亚州的犯罪实验室合作,以测试自动化系统。

我飞出来并设置系统。我们向他们展示了一切效果,当它到摇晃的部分时,他们的眼睛疯狂,他们说,“这不起作用。”我们告诉他们只是为了解决他们的样品,我回到Promega。当他们努力工作时,他们的空白是完全空白的。

Paraj Mandrekar研究科学家*:2001年8月和9月初,我在做一项从小块组织中分离DNA的研究。我是用手做的,但方式可以适应机器人。我记得当时在想‘我不知道为什么我们会这么做’,但我可以在机器人上做一些组织,比如每次88块。一周半后,人们会说:“嘿,你在机器人上玩纸巾吗?因为我想这就是我们现在需要的…”

2001年9月11日,阿尼·马西贝(Arni Masibay)听到有关袭击的消息时,正在佛罗里达州的家中办公。在最初的冲击消退后,阿尼意识到Promega处于一个独特的位置,可以支持一些后续工作。

ARNI Masibay,法医区域账户经理:它突然出现在我的脑海中,他们将不得不收集和收集所有的样品,将它作为一个犯罪现场,我不知道他们会做多少,但这是我发现的一个挑战,Promega可以是有益的。当时,我非常了解GI研究科学家正在进行的项目,其中之一就是自动化。所以我试着联系纽约首席法医办公室接电话的人是一个实验室主任,我以前没和他说过话,但当我解释我想做什么时,我清楚地记得他说:“我就是你要找的人。”

Michelle Mandrekar,研究科学家:在他们进行测试之前,我们需要证明[DNA IQ]可以纯化线粒体DNA,以防它是一个降解的样本,无论是从立即崩溃还是从收集到它的时间。我在哺乳动物身上找到了这些保守序列的引物,所以在9/11事件发生后的几天,Paraj和我周六在实验室做了PCR,以证明我们可以提取线粒体DNA。我们能够证明这种线粒体序列可以在DNA IQ样本中检测到。能够做点什么真的很值得。每个人都在看着对方说,“我们该怎么办?”实际上我们必须在实验室里,我们必须做一些能够帮助人们的事情。

确定9/11受害者

2001年9月17日,包括艾伦·特莱巴和阿尼·马西拜在内的一群Promega科学家飞往纽约市,在首席验尸官办公室(OCME)建立了人类遗骸DNA自动纯化系统。

七天后,鲍勃·麦克拉伦加入了这个小组,他们飞往纽约州奥尔巴尼,在那里,纽约州警方正准备处理来自失踪人口的参考样本。

Arni Masibay:我们是最早飞往纽约的飞机之一。当我在飞机上时,我回忆起一种奇怪的感觉,因为它是如此安静。当我们着陆时,每个人都在鼓掌,你几乎可以在飞机上轻松地放松下来。

纽约市首席法医办公室将帕奇交给了艾伦·特里巴因为他参与了911袭击的反应。

艾伦Tereba:到处都是士兵,我们必须通过三个检查站。他们会问我们,“你们为什么在这里?”你为什么想进去呢?”他们翻了我们的行李,背包,所有东西。我们去了OCME所在的大楼我们对他们建立的机器人系统进行了编程。那是一段令人筋疲力尽的时光。我们每天工作12个小时,也许更多,然后回过头来,写下我们所做的。

Paraj Mandrekar:我的工作转向了在Promega校园做实验,然后将实验结果传达给现场。例如,其中一个问题是许多组织样本在使用的条件下无法溶解。因此,我们在现场进行了实验,然后发送电子邮件和更新,告知哪些有效,哪些无效。

艾伦Tereba:但这不是故事的结尾。当您尝试识别示例时,还需要参考样本。奥尔巴尼有纽约州警察实验室,与牙刷,梳子,其他物品一起使用。我们飞行起来建立了另一组机器人系统。

Bob McLaren,技术服务科学家*:我永远记得的一件事是,当我们走进实验室时,有一个机器人,我们准备做我们的程序,但实验室里到处都是棕色的纸袋,所有这些纸袋上都有人们的名字。那些是失踪人员的参考样本。这句话击中要害了,这是人的生命。那些已经离开我们的人。所以,当你走进实验室时,你会注意到这一点。你知道这就是你来这里的目的。我将永远记住那一幕。


二十年后,OCME是还在工作用最新的DNA鉴定技术鉴定从世贸中心找到的遗骸。

在我们缅怀2001年9月11日的事件和缅怀那些失去生命的人之际,我们向所有为DNA鉴定技术奠定基础的科学家们,以及所有继续致力于进一步推动这些技术的人表示感谢。


*职位名称反映2001年的职位。
艾伦·特雷巴于2006年从Promega退休。
Paraj Mandrekar现在是一位技术服务科学家。
Bob McLaren现在是一个SR研究科学家。


纽约市首席法医办公室助理主任Mark Desire将在第32届人类鉴定国际研讨会(ISHI)上发表主旨演讲。他的演讲将讲述OCME法医科学家和世贸中心遇难者家属的艰难和毅力,以及正在进行的查明当天所有遇难者身份的工作。一个小组还将讨论20年来9/11调查在全世界法医学方面取得的进展。报名参加会议的时间石城新闻网。


想了解更多关于法医DNA分析的进展,请查看我们最近的文章,骨骼中的故事:9/11后20年的DNA法医分析


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Jordan Villanueva在2017年加入Promega之前研究了西北大学的书写和生物学。作为一个科学作家,他对科学的人类最感兴趣 - 这些故事和人们背后的文章背后的人。研究兴趣包括免疫学和神经科学,以及Covid-19大流行。当他没有工作时,约旦喜欢转向酵母烘焙进入科学。这只是一种酵母和乳酸菌的共生文化,右图?

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