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David Goodsell的SARS-2-CoV图像
David Goodsell拍摄

在九个月以来COVID-19的第一个病例在武汉,中国被发现,该病毒有在全球范围内传播和感染的超过22万人。如同所有的新发传染病,我们经常用的问题多于答案发现自己。然而,通过全球的研究人员,医生和公共卫生官员的不懈努力,我们已经学到了很多的病毒,它是如何传播以及如何遏制它。

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旧药物的新用途:Remdesivir和COVID-19

随着来自美国和世界各地的COVID-19大流行至今,对疾病的战斗继续加剧。多么希望一直寄托在疫苗开发。然而,疫苗是一个长期的,预防性的策略。立即需要药物来对抗COVID-19已经加速了各种潜在的治疗方法努力(见开发对抗冠状病毒新疗法的竞赛)。

Remdesivir起源的故事

冠状病毒三维模型

remdesivir是一种受到广泛关注的药物。瑞德西韦是吉利德科学公司2009年开始的一项针对丙型肝炎病毒(HCV)和呼吸道合胞病毒(RSV)的研究开发的(1)。目前,瑞德西韦被列为正在研究的新药(IND),在世界任何地方都没有批准用于治疗。

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联系与合作:在COVID-19大流行期间,全球科学家如何相互支持

世界各地的许多研究实验室已经暂时关闭响应COVID-19大流行大门,而其他人也遇到了试剂进行病毒检测前所未有的需求。这种迫切性已经导致许多科学家做出新的连接,并建立创新,协作解决方案。

客户支持专家托尼•范登•布什(Tony Vanden Bush)表示:“在那些仍在为测试或其他目的而开放的实验室里,焦虑肯定会加剧。”“我现在觉得,我需要帮助他们处理压力,无论如何可能。”

上周,托尼是由明尼苏达大学的实验室联系,准备作为二级COVID-19测试设施附近的医院实验室。这两个实验室需要每天处理6000样品,和大学实验室的能力。

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紧急使用授权:什么,为什么和如何

这篇博客是由客座博客作者Heather Tomlinson写的,她是Promega的临床诊断主任。

为人类疾病找到安全有效的治疗方法需要时间。药物和诊断测试可能需要几十年才能发现、发展和证明安全有效。在美国,食品和药物管理局是确保治疗和测试可靠和安全的黄金标准看门人。我们等待审查和清除的时间意味着无效或不安全治疗的风险更低。

然而,在一场大流行中,我们甚至在开始开发诊断测试的竞赛之前就落后了,而诊断测试对于了解一种传染病是如何传播的至关重要。这就是像FDA的紧急使用授权快速通道(EUA)这样的程序至关重要的时候。这样的授权使科学家和临床医生能够灵活地尽快提供最好的试验方案,并理解随着新信息的出现,这些方案将继续得到评估和改进。EUA集中资源并加速审查,使科学保持领先地位,使我们有最好的机会保持安全和治愈。

Maxwell 48 RSC仪器和Maxwell RSC总病毒核酸分离试剂盒现在被列为CDC EUA协议的选项。

对于夜以继日工作的科学家来说,FDA的EUA流程已经准备好进行审查和回应。获得EUA为临床实验室提供了一个非常具体的经过测试的资源,指导他们在危机中使用工具和测试。

典型地,疾病控制中心(CDC)将开发获得FDA EUA响应于像一个大流行的危机第一测试或协议。对于COVID-19CDC 2019-新型冠状病毒实时RT-PCR诊断面板2月初获得FDA EUA认证这是公共卫生实验室与疾病预防控制中心和世界各地的测试制造商合作使用的测试协议。

在当前大流行等危机期间,科学家们不断努力改进检测方案,并为EUA方案增加选项。这使得测试协议具有更大的灵活性。Promega有幸参与了CDC EUA的诊断测试。我们的GoTaq®探针1步PRT-qPCR系统是在CDC定量PCR诊断测试预混液几批准选项之一,现在我们的中等吞吐量麦克斯韦48仪器Maxwell病毒总核酸纯化试剂盒已经添加到CDC协议作为RNA分离步骤的一个选择。美国疾病控制与预防中心EUA的增加意味着实验室有更多的资源可用于诊断测试,这对有效应对大流行至关重要。

紧急使用授权提供了FDA的指导突发事件,比如目前COVID-19大流行期间加强我们国家的公共健康。该EUA允许通过在所有的学术界,政府和行业确认和资格最可靠的技术和系统协同工作的科学家授权协议的持续改进,使实验室的更多的灵活性,新产品增加了作为选择。

Tomlinson博士是Promega公司全球临床诊断战略事业部的主管,在临床诊断测试开发方面拥有超过15年的经验。她负责领导Promega临床市场策略的团队。她的背景是传染病诊断测试,重点是艾滋病毒的耐药性和进化。她最近的工作是在肿瘤伴生诊断测试的发展。希瑟是一个有成就的国际演讲者,在美国、欧洲、亚洲和非洲发表会议演讲。

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抗体、免疫和疫苗:适应性免疫反应的短引物

MERS-CoV的信用:NIAID

我们的皮肤、呼吸系统和胃肠道不断受到来自潜在病原体(如SARS-CoV-2)的环境挑战。然而,这些接触通常不会引起疾病,因为我们的免疫系统会保护我们。人类的免疫系统是复杂的。它对损伤和疾病有快速、非特异性的反应,也有长期、特异性的病原体反应。了解免疫反应是如何工作的有助于我们了解一些病原体是如何通过免疫反应以及如何阻止免疫反应的发生。它还提供关键信息,帮助我们开发安全有效的疫苗。

免疫反应包括两个互补的途径:先天免疫和适应性免疫。先天免疫是非特异性的、快速的,在受伤或感染后迅速产生。作为先天免疫反应的结果,细胞因子(小信号分子)被分泌来招募免疫细胞到损伤或感染部位。先天免疫不会形成抗原的“记忆”,也不会产生长期免疫。

免疫反应涉及互补途径:先天免疫和适应性免疫。

与先天免疫不同,适应性免疫既依赖抗原又具有特异性,这意味着适应性免疫反应需要有触发抗原的存在——类似于病毒表面的刺突蛋白。适应性免疫反应也针对触发反应的抗原。适应性免疫反应需要更长的时间来发展,但它有能力记忆形式的记忆B和T细胞。在随后的抗原暴露中,这种记忆能够使快速、特异性免疫反应(免疫)成为可能。

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回到板凳上

今天的博客由技术服务科学家Joliene Lindholm博士撰写。

我们中的许多人已经回到实验室经过一个夏天的领域工作或度假休息,但通常是有人检查的实验室,以确保凝胶电泳盒没有完全充斥着死虫和水浴锅并不完全令人兴奋的新藻类泛滥成灾。也许这只是因为我在一栋旧建筑的昆虫学系工作,但昆虫为什么这么喜欢使用缓冲器呢?在这一点上,一些实验室已经完全关闭了几个月,或者可能只有一些重要的人在维持股票和菌落的运行。一些实验室已经适应了新的常态,并制定了一些指导方针,以确保研究人员在仍在实验室进行重要工作的同时安全Promega科学应用集团维持着这种平衡

回到实验台上?花点时间确保你拥有开始研究项目所需要的一切。

在经过一段时间的实地工作后,我从管理实验室中学到了一些技巧,这些技巧可以帮助我重新回到工作中来:

继续阅读"回到长椅上"

冠状病毒研究中荧光素酶标记报告假病毒颗粒测定的选择

冠状病毒(冠状病毒)的研究人员迅速行动起来,了解SARS-COV-2进入细胞。一个冠状病毒的表面上的穗或S蛋白是三聚体。所述单体构成的S1和S2结构域组成。S1和S2的划分通过两个结构域之间的弗林蛋白酶切割位点发生在病毒产生细胞。三聚体结合至细胞表面蛋白。在SARS-CoV病毒的情况下,所述受体是血管紧张肽转化酶2(ACE2)。在MERS-CoV的利用细胞表面的二肽基肽酶IV的蛋白质。SARS-COV-2的用途ACE2为好。内化S蛋白推移虽然由宿主细胞蛋白酶的第二切割,称为S2'的S1 / S2裂解位点,这导致在构象的急剧变化被认为促进膜融合和病毒进入细胞(1)的附近。

CDC / Alissa Eckert女士;丹•希金斯播出

而不是直接与病毒的工作中,研究人员选择把假病毒颗粒。假型病毒颗粒包含公知的亲本病毒的包膜蛋白(如。)与本地宿主细胞结合蛋白(如。,糖蛋白G)交换被研究病毒的宿主细胞结合蛋白(S蛋白)。这种伪病毒粒子通常携带一个报告质粒,最常见的是萤火虫荧光素酶(FLuc),并携带必要的基因元素,将其包装在粒子中。

为了制造假病毒颗粒,将质粒或RNA单独转染到细胞中,假病毒通过内质网和高尔基体从细胞中芽入培养基中。假病毒被用来研究病毒通过交换蛋白进入目标病毒的过程。通过对报告者的分析来监测输入。报告者可能是荧光素酶或荧光蛋白。

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在首次发布38年后,RNasin保护了COVID-19检测

Promega在近40年前首次纯化并销售的一种蛋白质已成为许多COVID-19检测工作流程中的关键工具。RNasin®核糖核酸酶抑制剂于1982年首次发布,距公司成立仅四年时间。当时整个Promega的目录就在一张8.5×11”的纸上,而RNasin是第一批引起广泛关注的Promega产品之一。今天,由于该产品支持实验室应对COVID-19大流行,对这一基础产品的需求急剧上升。

什么是RNasin®核糖核酸酶抑制剂?

RNA是RNA酶众所周知的容易受到污染。这些酶通过破坏磷酸二酯键形成分子的主链降解RNA。如果说核糖核酸到处都是勉强夸张 - 几乎所有已知生物体产生某种形式的核糖核酸酶,和他们常用的各种生物样品中发现。他们很容易地引入到实验系统,因为即使人的皮肤分泌的RNA酶的一种形式。一旦他们存在,它是很难摆脱他们。即使是在高压釜不能灭活核糖核酸;酶将重新折叠,并保留了许多原有的活动。

RNA酶抑制剂®核糖核酸酶抑制剂是一种蛋白质,已被证明可以抑制许多常见的污染rna酶,但不会破坏逆转录酶等酶的活性,这可能对实验至关重要。它通过与RNase酶结合,阻止它作用于RNA分子。这对于确保RNA样本在进行复杂的分析之前是完整的非常重要。

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在家工作:在这种新常态下发现效率

在适应新常态的这段时间里,我不得不习惯的最困难的事情之一就是在我自己的家里保持高效率。在家工作(WFH)被一些人接受,而不是其他人。对我来说,从在办公室和学校工作过渡到在家工作并完成在线课程,这让我开始寻找如何充分利用一天的时间的答案。在为我创造了一个高效的在家工作环境之后,我想和你们分享我的一些发现。

下面是一些我认为有用的建议:

科你家只工作的一部分。

当我刚开始在家里工作,我搬到房间到另一个房间工作的地方,我觉得最舒服的。我很快发现这影响了我的组织和时间管理,所以我开始将我所有的工作在一个区域。现在,我坐在这里写这篇文章,我知道所有我的工作是,我也知道,当我走在这一领域的出来,我可以“断电”我的心知道我不再需要做的工作。

当电子设备不工作时,请关闭电源。

继续阅读《在家工作:在新常态下寻找生产力》

中和抗体的SARS-CoV-2显示减少感染小鼠

在美国,就像在世界各地一样,我们开始摆脱COVID-19的隐藏,不管是强制的还是自愿的。我们正在慢慢地开始走出家庭的局限和“更安全的家庭”的秩序。我们中的许多人都戴着面具,在需要的时候外出,仍在考虑保持社交距离。

我们期待有一天,社交距离不再必要,我们可以见到我们的亲人和朋友,给他们一个拥抱,而不用担心他们或我们自己的安全。

那个时刻什么时候会到来?许多人认为,除非有一种有效的疫苗来保护我们免受SARS-CoV-2的感染,否则它不会是完全安全的。

疫苗如何保护我们?有效的疫苗能使我们的免疫系统产生针对SARS-CoV-2的特异性抗体,这样当我们接触到病毒时,它就会被中和,从而防止感染。

目前,关于SARS-CoV-2病毒是否会引起抗体的产生还有许多问题。如果产生抗体,它们有保护作用吗?

本周有一些令人兴奋的消息,研究SARS-CoV-2的科学家们已经表明,这种病毒的中和抗体可以在人体内产生。让我们来看看他们的工作。

继续阅读抗SARS-CoV-2的中和抗体可以减轻小鼠的感染